Depuis, sa présence s’est confirmée dans au moins 33 pays au 13 avril 2026, selon les données du CDC. Il alimente les niveaux les plus élevés de contamination en Australie, au Danemark, en Allemagne et aux Pays-Bas. Aux États-Unis, où le premier cas a été détecté en juin 2025 chez un voyageur, le BA.3.2 circule désormais dans 31 États.
Si la progression du variant s’accélère, les autorités sanitaires soulignent que sa circulation reste pour l’instant modérée comparée aux souches dominantes. L’augmentation du nombre de pays touchés reflète en partie une meilleure capacité de détection — en particulier grâce à la surveillance des eaux usées.
L’Omicron BA.3, un ancêtre ressurgi
Le SARS-CoV-2 a donné naissance à de nombreuses lignées depuis son émergence en 2019. La famille Omicron, apparue fin 2021, a progressivement dominé les infections mondiales. Parmi ses sous-lignées, BA.3 était restée très marginale à l’époque. Le BA.3.2 illustre la capacité du virus à reprendre une trajectoire évolutive abandonnée et à accumuler discrètement des mutations sur plusieurs années, loin des circuits de surveillance habituels.
Une divergence génétique sans précédent : jusqu’à 75 mutations sur le spike
Le BA.3.2 est un descendant direct de la lignée Omicron BA.3, identifiée en 2022. Plutôt que d’évoluer en parallèle des variants dominants, il a suivi une trajectoire indépendante pendant plus de trois ans, accumulant des modifications génétiques à un rythme inhabituel.
Le résultat est saisissant : la protéine de pointe (spike) du BA.3.2 cumule entre 70 et 75 mutations. C’est le double, voire davantage, de ce que présentent les variants récents comme JN.1 ou LP.8.1, qui en comptent entre 30 et 40. C’est précisément cette protéine que le virus utilise pour pénétrer dans les cellules humaines — et celle que les vaccins apprennent au système immunitaire à reconnaître.
Cette divergence génétique exceptionnelle a été documentée dans une publication de The Lancet Infectious Diseases. Les chercheurs s’interrogent sur les conditions qui ont permis une telle accumulation de mutations : un réservoir animal intermédiaire, une immunodépression prolongée chez un hôte, ou une circulation dans des populations faiblement immunisées figurent parmi les hypothèses explorées.
Vaccins et antiviraux : quelle protection face au Cigale ?
La question centrale posée par le profil mutationnel du BA.3.2 est celle de l’efficacité des vaccins actuels. Les formulations disponibles ont été conçues sur la base de la lignée JN.1 : face au BA.3.2, elles offrent encore une protection partielle, mais la réponse immunitaire qu’elles déclenchent est sensiblement plus faible qu’attendu contre cette souche.
Une donnée rassurante toutefois : les antiviraux existants contre le SARS-CoV-2 demeurent efficaces contre le BA.3.2. Pour les personnes à risque, ce traitement précoce reste donc une option valide en cas d’infection confirmée.
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